概要
- Thermus thermophilus HB8 Disruption plasmids were constructed by “Whole-Cell Project of a Model Organism, Thermus thermophilus HB8” (http://www.thermus.org/) and deposited by Dr. Seiki Kuramitsu, SR System Biology Research Group, RIKEN Harima Institute; Individual clones are available.
- The gene disruptant of T. thermophils HB8 can be easily prepared by adding this plasmid into the culture medium. The target gene in this plasmid was replaced by the thermostable kanamycin resistant gene from Staphylococcus aureus. The length of the homologous region outside of the target gene is about 500 bp (only 10 bp of the target gene are left in both sides).
提供形態ならびに提供申込方法
- Thermus thermophilus HB8の遺伝子を耐熱性カナマイシン (Staphylococcus aureus) で置き換え、遺伝子破壊するためのプラスミドです。
- 個別クローンの番号はList of Genesのページで検索してください。
- クローンはＤＮＡ溶液 (TE buffer)でお送りします。
- お受け取り後のDNAの増幅には、反復配列を持つ不安定な遺伝子のクローニングに適したホスト大腸菌（例：Stbl2、インビトロジェン等）を使用してください。
生物遺伝資源提供依頼書類の入手と記入
次の書式に記入してください:
- 書式A
- 遺伝子材料名欄には１行目に「Thermus thermophilus破壊株作製用プラスミド」を記入
- 2行目から提供を希望される「クローンの番号 (例：TDs01A01)を記入
- カタログNo. (RDB)欄の記入は不要
書式A （遺伝子材料提供依頼書） [Word] 1部 - 書式C
- リソース名は「Thermus thermophilus破壊株作製用プラスミド（別添参照）」を記入
- 固有記号欄の記入は不要
- リソースの利用条件欄には次の1点を記入
「利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者が指定する文献を引用する (Yokoyama et al., 2000, Nature Struct. Biol. 7, 943-945)。」 - 利用目的により、非営利学術目的用あるいは営利目的用を選択してください。
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 非営利学術目的用 [Word]
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 営利目的用 [Word]2部
書類の送付とお問い合わせ
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提供手数料：（1本あたり)
| 非営利学術目的 | 8,640円 |
| 営利目的 | 17,280円 |
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Data Sheet
| Vector | pGEM derivative |
| thermostable kanamycine resistant gene | from Staphylococcus aureus |
| Sequencing Primer (Vector toward insert) |
T7long: cgccaagctctaatacgactcactataggg SP6: atttaggtgacactatag |
| Sequencing Primer (Km toward insert) |
7723km F：aatttctggaatggggttca 7723km R：gattgcgatgctgattcgt |
Articles Published by Using This Materials
| Author | Title | Journal | PMID |
|---|---|---|---|
| Ueta, M., Wada, C., Daifuku, T., Sako, Y., Bessho, Y., Kitamura, A., Ohniwa, R.L., Morikawa, K., Yoshida, H., Kato, T., Miyata, T., Namba, K., Wada, A. | Conservation of two distinct types of 100S ribosome in bacteria. | Genes Cells, 18 (7): 554-574 (2013). | 23663662 |
| Shimada, A., Masui, R., Nakagawa, N., Takahata, Y., Kim, K., Kuramitsu, S., Fukui, K. | A novel single-stranded DNA-specific 3′-5′ exonuclease, Thermus thermophilus exonuclease I, is involved in several DNA repair pathways. | Nucleic Acids Res., 38 (17), 5692-5705 (2010). | 20457749 |
| Tomikawa C., Yokogawa T., Kanai T., Hori H. | N7-Methylguanine at position 46 (m7G46) in tRNA from Thermus thermophilus is required for cell viability at high temperatures through a tRNA modification network. | Nucleic Acids Res., 38, 942-957 (2010). | 19934251 |
関連情報
- Thermus thermophilus HB8遺伝子の組換えタンパク質を大腸菌で発現するためのプラスミド
- Thermus thermophilus HB8 (JCM 10941T) 菌株はBRC-JCMから入手可能です。
- Thermus thermophilus HB8 ゲノムDNAは、当バンクから入手可能です
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html - Thermus thermophilus HB8 ゲノム情報は、 DDBJから入手可能です
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Hoseki, J., Okamoto, A., Takada, N., Suenaga, A., Funatsugi, N., Konagaya, A., Taiji, M., Yano, T., Kuramitsu, S. and Kagamiyama, H. (2003)
Biochemistry 42, 14469-14475
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Hashimoto, Y., Yano, T., Kuramitsu, S. and Kagamiyama, H. (2001)
FEBS Lett. 506, 231-234
Directed Evolution of Thermostable Kanamycin-Resistant Gene Products in an Extremely Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus
Hoseki, J., Yano, T., Koyama, Y., Kuramitsu, S. and Kagamiyama, H. (1999)
J. Biochem. 126, 951-956
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|---|---|---|---|
| RDB03436 | DNA clone | pUC18-HTK (with promoter) | Expression vector of Thermus highly thermostable kanamycin nucleotidyltransferase (HTK) gene |
(GRP0035j, 2012.10.22 T.M.)
2018.11.15