概要
- 理化学研究所 播磨研究所 放射光科学総合研究センター/大阪大学 倉光成紀先生より寄託していただいた、”高度好熱菌 (Thermus thermophilus HB8) 丸ごと一匹プロジェクト” で構築された、組換えタンパク質を大腸菌で発現するためのプラスミドです。
提供形態ならびに提供申込方法
発現 個別クローン
- 大腸菌でThermus thermophilus遺伝子を発現するためのプラスミドです。
- 個別クローンの番号はList of Genesのページで検索してください。
- クローンはＤＮＡ溶液 (TE buffer)でお送りします。
生物遺伝資源提供依頼書類の入手と記入
次の書式に記入してください:
- 書式A
- 遺伝子材料名欄には１行目に「Thermus thermophilus遺伝子発現プラスミド」を記入
- 2行目から提供を希望される「クローンの番号 (例：TEx01A01)を記入
- カタログNo. (RDB)欄の記入は不要
書式A （遺伝子材料提供依頼書） [Word] 1部 - 書式C
- リソース名は「Thermus thermophilus遺伝子発現プラスミド（別添参照）」を記入
- 固有記号欄の記入は不要
- リソースの利用条件欄には次の1点を記入
「利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者が指定する文献を引用する (Yokoyama et al., 2000, Nature Struct. Biol. 7, 943-945)。」 - 利用目的により、非営利学術目的用あるいは営利目的用を選択してください。
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 非営利学術目的用 [Word]
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 営利目的用 [Word]2部
書類の送付とお問い合わせ
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提供手数料：（1本あたり)
| 非営利学術目的 | 8,640円 |
| 営利目的 | 17,280円 |
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Data Sheet
| 1. | Thermus thermophilus HB8 expression plasmid | ||
| 1.1 | Strain information | ||
| Species | Thermus thermophilus | ||
| Strain | Thermus thermophilus HB8 | ||
| 1.2 | Clone information | ||
| Vector | pET-11a (Ampr), pET-11b (Ampr) or pET-3a (Ampr) | ||
| Insert | genomic DNA | ||
| Host | Plasmid was amplified using DH5alpha, E. coli | ||
| Clone data | Available at Thermus thermophilus gene plasmid | ||
| 1.3 | Reference | ||
| 1 | Yokoyama, S., Hirota, H., Kigawa, T., Yabuki, T., Shirouzu, M., Terada, T., Ito, Y., Matsuno, Y. Kuroda, Y., Nishimura, Y., Kyogoku, Y., Miki, K., Masui, R., Kuramitsu, S. (2000) Structual genomics projects in Japan. Nature Struct. Biol. 7, 943-945. | ||
| 2 | Structural-Biological Whole Cell Project | ||
| 3 | Thermus thermophilus gene plasmid | ||
| 4 | Whole Cell Project Database | ||
関連情報
- Thermus thermophilus HB8の遺伝子を耐熱性カナマイシン (Staphylococcus aureus) で置き換え、遺伝子破壊するためのプラスミド
- Aeropyrum pernix 遺伝子の組換えタンパク質を大腸菌で発現するためのプラスミド
- Sulfolobus tokodaii 遺伝子の組換えタンパク質を大腸菌で発現するためのプラスミド
- Thermus thermophilus HB8 (JCM 10941T) 菌株はBRC-JCMから入手可能です。
- Thermus thermophilus HB8 ゲノムDNAは、当バンクから入手可能です
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html - Thermus thermophilus HB8 ゲノム情報は、 DDBJから入手可能です
このリソースを用いた文献
| Author | Title | Journal | PMID |
|---|---|---|---|
| Diederichs, S., Korona, A., Staaden, A., Kroutil, W., Honda, K., Ohtake, H., Buchs, J. | Phenotyping the quality of complex medium components by simple online-monitored shake flask experiments. | Microb. Cell Fact. 13 (1): 149 (2014). | 25376163 |
| Shimada, A., Kawasoe, Y., Hata, Y., Takahashi, T.S., Masui, R., Kuramitsu, S., Fukui, K. | MutS stimulates the endonuclease activity of MutL in an ATP-hydrolysis-dependent manner. | FEBS J., 280 (14): 3467-3479 (2013). | 23679952 |
| Hibino, A., Petri, R., Buchs, J., Ohtake, H. | Production of uroporphyrinogen III, which is the common precursor of all tetrapyrrole cofactors, from 5-aminolevulinic acid by Escherichia coli expressing thermostable enzymes. | Appl. Microbiol. Biotechnol., 97 (16): 7337-7344 (2013). | 23604563 |
| Tomoike, F., Kuramitsu, S., Masui, R. | Unique substrate specificity of purine nucleoside phosphorylases from Thermus thermophilus. | Extremophiles, 17 (3): 505-514 (2013). | 23546840 |
| Matsumoto, A., Shimizu, Y., Takemoto, C., Ueda, T., Uchiumi, T., Ito, K. | Crystallization and preliminary X-ray analysis of peptidyl-tRNA hydrolase from Thermus thermophilus HB8. | Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 69 (Pt 3): 332-335 | 23519816 |
| Ito, Y., Mikawa, T., Smith, B.O. | In-cell NMR of intrinsically disordered proteins in prokaryotic cells. | Methods Mol. Biol., 895: 19-31 (2012). | 22760309 |
| Chiba, Y., Oshima, K., Arai, H., Ishii, M., Igarashi, Y. | Discovery and Analysis of Cofactor-dependent Phosphoglycerate Mutase Homologs as Novel Phosphoserine Phosphatases in Hydrogenobacter thermophilus. | J. Biol Chem. 287 (15): 11934-11941 (2012). | 22337887 |
| Agari, Y., Kuramitsu, S., Shinkai, A. | Crystal structure of hypothetical protein TTHB210, controlled by the σE/anti-σE regulatory system in Thermus thermophilus HB8, reveals a novel homodecamer. | Proteins 80 (3): 958-962 (2012). | 22231934 |
| Tomoike, F., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R. | A single amino acid limits the substrate specificity of Thermus thermophilus uridine-cytidine kinase to cytidine. | Biochemistry 50( 21): 4597-4607 (2011). | 21539325 |
| Kondo N., Ebihara A., Ru H., Kuramitsu S., Iwamoto A., Rao Z., Matsuda Z. | Thermus thermophilus-derived protein tags that aid in preparation of insoluble viral proteins. | Anal. Biochem., 385, 278-285 (2009). | 19084492 |
このリソースに関連する文献
| Title | Journal | Author | PMID |
|---|---|---|---|
| Molecular mechanisms of the whole DNA repair system: a comparison of bacterial and eukaryotic systems. | J. Nucleic Acids 2010:179594 (2010). | Morita, R., Nakane, S., Shimada, A., Inoue, M., Iino, H., Wakamatsu, T., Fukui, K., Nakagawa, N., Masui, R., Kuramitsu, S. | 20981145 |
(GRP0051 T.M.)
2018.11.15