概要
京都大学にて開発され、理研GSCによるゲノム解析が行われたラット BACクローンが寄託されました。得られた各クローンのBACエンド配列をラットゲノム配列上にマッピングし、「F344 & LE Rat BAC ブラウザ」として公開しています。研究者は、このブラウザ上で目的とするゲノム領域のBACクローン（F344/StmもしくはLE/Stm由来）を選択し、利用することが可能です。
参考サイト
- ナショナルバイオリソースプロジェクト ラット
- 英国科学雑誌「Nature Genetics ５月号（ラット特集号）」にラットリソースプロジェクト（NBRP-Rat）の事業成果及び関連研究が掲載されました。(京都大学、2008.4.29)
提供形態ならびに提供申込方法
- NBRP Rat BACクローンは組換え体スタブアガーでお送りします。
- クローンを受け取ったら、単コロニーの分離をしてください。培養は50 ug/mL Ampを添加した2x LBを使います。
- クローンは外部データベース F344 & LE Rat BAC ブラウザでクローンを検索し、様式ダウンロードページで入手した書式に必要事項を記入し、書式を作成してください。
BAC clone browserによるBACクローンの検索 (BAC clone browser by the National Institute of Genetics) - 液体培養とＤＮＡの調製は「BAC クローンの取り扱い」をご覧下さい。
- ベクター情報はData Sheet
をご覧ください。 - 文献情報はInformaion site F344
並びにLE をご覧ください。
生物遺伝資源提供依頼書類の入手と記入
次の書式に記入してください:
- 書式A
- 提供を希望される「クローンの番号 (例：RNB1-456A01)」を記入
- カタログNo. (RDB)欄の記入は不要
書式A （遺伝子材料提供依頼書） [Word] [依頼書の記入例] 1部
- 書式C
- リソース名は「NBRP Rat BAC clone RNB1ならびにRNB2（別紙書式Ａ参照）」を記入
- 固有記号欄の記入は不要
- リソースの利用条件欄には次の1点を記入
「利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者の指定する文献を引用する (The STAR Consortium, SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat. Nat. Genet. 40, 560-566, 2008)。」 - 利用目的により、非営利学術目的用あるいは営利目的用を選択してください。
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 非営利学術目的用 [Word]
書式C (生物遺伝資源提供同意書, MTA) 営利目的用 [Word]2部
- その他の書式
遺伝子組換え生物の提供です。遺伝子組換え生物の受入れ確認書（書式J）をお送りください。 1部
提供手数料:（１株あたり)
| 非営利学術目的利用 | 9,460円 |
| 営利目的利用 | 18,920円 |
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書類手続きにつきましては、PDFでの取り交わしを推奨しています。
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使用上の注意
第二種使用等を目的とした遺伝子組換え生物です。
| 核酸の名称（リソース名） | ラット BAC クローン |
| 宿主 | E. coli (DH10B) |
| ベクター | pKS145 (DDBJ/EMBL/GenBank AB013921) |
| 供与核酸（挿入遺伝子の名称） | ラットゲノムDNA |
| 拡散防止措置の区分 | P1 |
関連情報
国立がん研究センター研究所の中釜斉博士ならびに落合雅子博士が樹立したラットF344/Jcl 系統ならびにACI/NJcl 系統のBACクローン化ライブラリーも収集しています。F344/Jcl 系統はすでに当開発室から提供を開始しているBACクローン化ライブラリーの F344/Stm 系統とは異なる亜系統です。もう一つのACI/NJcl 系統は、遺伝子解析が進んでいるBN系統やF344系統と遺伝的に離れており、発がん感受性、偏腎症の発症、独自の主要組織適合遺伝子複合体（RT1）タイプを持つこと等が挙げられ、疾患モデルとして非常に有用な系統です。
(GRP0040j 2008.02.14 T.M.)
2023.10.27
