概要
岡崎国立共同研究機構・生理学研究所にて開発され、理研GSCによるゲノム解析が行われたニホンザル BACクローンが寄託されました。
National Bioresource Project Macaque Monkeys
The nucleotide sequencing was done by the National Institute for Physiological Sciences and the National Institute of Genetics under the MEXT NBRP Japanese Macaques Genome Information Upgrading Program.
提供形態ならびに提供申込方法
- 個別クローンを発注される方は、外部データベースJapanese macaque BAC ブラウザでクローンを検索し、様式ダウンロードページで入手した書式に必要事項を記入し、書式を作成してください。
BAC clone browserによるBACクローンの検索 (BAC clone browser by the National Institute of Genetics)
- NBRP Japanese macaque BACクローンは組換え体スタブアガーでお送りします。
- クローンを受け取ったら、単コロニーの分離をしてください。培養は50 ug/mL Ampを添加した2x LBを使います。
- ベクター情報はをご覧下さい。
- 液体培養とDNAの調製は「BAC クローンの取り扱い」をご覧下さい。
生物遺伝資源提供依頼書類の入手と記入
次の書式に記入してください:
- 書式A
- 提供を希望される「クローンの番号 (例:MSB2-120J15)」を記入
- カタログNo. (RDB)欄の記入は不要
書式A (遺伝子材料提供依頼書) [Word] [依頼書の記入例] 1部
- 書式C
- リソース名は「NBRP Japanese macaque BAC clone MSB2(別紙書式A参照)」を記入
- 固有記号欄の記入は不要
- 書式C のリソースの利用条件欄には次の1点を記入
「利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者が指定する文献を引用する。」
書式C (生物遺伝資源提供同意書, 非営利学術目的用) [Word] 2部
- その他の書式
遺伝子組換え生物の提供です。遺伝子組換え生物の受入れ確認書(書式J)をお送りください。 1部
提供手数料:(1株あたり)
非営利学術目的利用 | 9,460円 |
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Remarks:
Japanese macaque is one of the animals as the object of Convention on International Trade in Endangered Species (CITES). Therefore, according to the CITES the permissions of the regulatory bodies are necessary in both exporting and importing countries.
Data Sheet
第二種使用等を目的とした遺伝子組換え生物です。
核酸の名称 (リソース名) | ニホンザル BAC クローン |
拡散防止措置の区分 | P1 |
宿主 | E. coli (DH10B) |
ベクター | pKS145 (AB013921) |
供与核酸 | ニホンザルゲノムDNA |
Japanese macaque BAC clone MSB2 information | |
Species | Macaca fuscata fuscata (Japanese macaque) |
Sex | male |
Clone information | |
Vector | pKS145 (SacI site, Ampr, AB013921) [pdf] |
Insert | SacI partial digestion |
Host | DH10B, E. coli |
Sequencing Primer | AFF, 5′- TTCCCAGTCACGACGTTGTA -3′, 5′ primer, 106 to 87 of AB013921. AFR, 5′- GGAATTGTGAGCGGATAACAA -3′, 3′ primer, 7466 to 7486 of AB013921. |
Nucleotide sequences | DNA Databank of Japan (DDBJ), AG613379-AG780537 |
Total number of clones (384-well plate) | MSB2, ca. 200,000 clones (521 plates) |
Average length | 120 kb |
関連情報
ニホンザル (Macaca fuscata fuscata) の ゲノム配列データ公開 (2018.04.11)
BLAST searching in National BioResource Project
Japanese and Rhesus Macaque BAC and fosmid browser
(by the Bioinformatics Research Lab at Baylor College of Medicine)
(GRP0041j 2009.06.13 T.M.)
2023.10.27