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Genome Network Project Human cDNA Clones

ヒト完全長cDNAクローンの概要

理研ＢＲＣ・遺伝子材料開発室では、文部科学省「ゲノムネットワークプロジェクト」が収集・整備したヒト完全長cDNAクローンの提供を行っています。ゲノムネットワークプロジェクトクローンは、次の２種類です。
1)ヒト完全長cDNAコレクション
東京大学の菅野純夫博士ならびに理化学研究所の林崎良英博士のグループが収集・整備。ヒトの全遺伝子の6割に相当するおよそ14,000遺伝子、約3万クローン。
2)Gateway®エントリークローン
ヒト完全長cDNAコレクションから抜粋した6,300遺伝子分、約5万クローン。Gateway®エントリークローンのインサートDNAは、Gateway®テクノロジーにより種々のデスティネーションベクター（発現ベクター）へ簡単に移入することができます。なお、Gateway®エントリークローンには、独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発研究機構「完全長cDNA構造解析プロジェクト」において、バイオテクノロジー開発技術研究組合が作製したヒトcDNAクローンから作製したクローンも含んでいます。

  • これらのヒト完全長cDNAクローンの開発と解析のプロジェクトの研究成果は、下記論文で発表され、クローンの詳細情報やタンパク質発現情報等がゲノムネットワークプロジェクトの公開データベース 「ゲノムネットワークプラットフォーム」から公開されています。

References:

  1. Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
  2. Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
  3. Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
  4. Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.

 

  • 配列検査に用いるプライマー配列はData Sheet をご覧ください。
  • 文献情報はInformaion site をご覧ください。
  • Gateway®テクノロジーについてはLife Technologies社の「Gateway クローニング」をご参照ください。
  • 独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)が提供していたヒトcDNAクローンは「一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム (JBIC) ヒトGateway(TM)エントリークローン事務局」ホームページをご覧下さい。

クローンの検索

  • キーワード検索の場合
  • A to Zリストの場合
    ご希望の遺伝子をA to Zリストで検索してください。

依頼の概要

■　当該クローンは学術機関による学術研究に限り提供可能です

依頼に必要な書式

  • 書式A (遺伝子材料提供依頼書)
    書式A （遺伝子材料提供依頼書） [Word] [依頼書の記入例]1部

    • 「カタログNo.」と「遺伝子材料名」は、次のように記載してください。
      カタログNo. 遺伝子材料名
      HGY088130 IRAL020F10
      HGY084224 IRAL010J08
      HGE091280 M01C028D08
      HGE009243 W01A023B19
  • 生物遺伝資源提供同意書、MTA
    ゲノムネットワークプロジェクトクローン専用ＭＴＡ （非営利学術目的用） [Word] 2部
    • ＭＴＡには、個々のクローン名の記載は不要です
    • 利用条件はＭＴＡにあらかじめ記載されています。
  • Gateway®テクノロジーにより作製されたバイオリソースを使用される場合は、「Gateway®テクノロジーを使用したバイオリソース提供時のライセンス料相当額改定のお知らせ [link]」の内容をお読み頂きLimited Use Label License: No.19 (GatewayR Cloning Products) [PDF]をダウンロードしてください。
  • 書類の送付とお問い合わせ
    書類手続きにつきましては、PDFでの取り交わしを推奨しています。

    • PDFでの取り交わしの可否については、事前にご所属の知財担当部署にご相談ください。
      カラースキャンしたPDFファイルをemailにてお送りください。

    • 公印押印済みMTAの原本（書面）の返送をご希望の場合は、原本（書面）2部を当室へお送りください。なお、書類の返送に係る送料をご負担いただきます。

    • 書類をPDFで取り交わす場合でも、締結済み書類の返送が別送となりそれに係る送料をご負担いただく場合がございます。
      例）　書類返送が別送となる場合の例
      1.　冷凍品（ゲノムDNA）や組換え体など、リソースを宅配便で配送する場合
      2.　リソースとは別の部署への書類の返送をご希望の場合
      3.　リソース発送前に書類返送をご希望の場合

    • 書類の送付先、問い合わせ先
      〒305-0074　 茨城県つくば市高野台3-1-1
      　 理化学研究所バイオリソース研究センター (BRC)
      　 遺伝子材料開発室
      　 E-mail: dnabank.brc@riken.jp
      　 TEL: 029-836-3612 (平日の9:00～12:00 / 13:00～17:00)

    • 提供申込の前に、「申込書類の記入と送付」「ご利用にあたって」「遺伝子材料の品質管理」をご覧ください。

    • 書式の詳細は「申込みに必要な書式」をご覧ください。

提供形態

  • DNA（約1μg）
  • 備考：
    提供前にプラスミド全長の配列確認をします。
    発送まで２週間のお時間を頂きます。ご了承下さい。

提供手数料

  • 提供手数料：（1本あたり)
    非営利学術目的利用9,460円
    • 2023年4月1日現在の提供手数料です。
    • 「非営利学術目的利用」および「営利目的利用」の区分ならびに「提供手数料」は、「提供手数料と支払方法」をご参照ください。
    • 別途、リソースの送料並びに箱代及びドライアイス代等が加算されます。
    • 請求書は提供依頼書に記載された「担当者」に送付いたします。特別な様式の請求書・納品書・領収書を必要とされる場合は、予めその旨をご相談いただくようお願いいたします。請求書は遺伝子材料とは別に送付いたします。
    • 提供手数料は指定の銀行口座にお振込みください。振込み手数料につきましては、依頼者負担にてお願い致します。
  • ベクターがpCMV SPORT6シリーズ(Gateway®発現ベクター)の場合、ライセンス料相当額 2,090円を追加でご負担いただきます。ライセンスについては「Gateway®テクノロジーを使用したバイオリソース提供時のライセンス料相当額改定のお知らせ [link]」をご覧下さい。

利用条件

  1. 利用者は、研究成果の公表にあたってバイオテクノロジー開発技術研究組合（以下「バイオ組合」という。）、理化学研究所 林崎 良英博士(林崎博士)並びに東京大学　菅野純夫教授(菅野教授)の指定する文献を引用する。
    • Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
    • Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
    • Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
    • Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.
  2. 利用者は、研究成果の公表にあたってバイオ組合、林崎博士並びに菅野教授への謝辞の表明を必要とする。
  3. 本件リソースの使用は学術機関による学術研究に限る。
  4. バイオ組合は本件リソースの使用による潜在的な第三者の特許、著作権、商標もしくはその他の所有権等の権利侵害等についていかなる保証をするものではない。利用者は、本件リソースの使用、保存、処分等によって生じるいかなる損害及び第三者からの損害賠償等の請求について全ての責任を負うものとする。

お問い合せ先

〒305-0074　 茨城県つくば市高野台3-1-1
　 理化学研究所バイオリソース研究センター (BRC)
　 遺伝子材料開発室
　 E-mail: dnabank.brc@riken.jp
　 TEL: 029-836-3612 (平日の9:00～12:00 / 13:00～17:00)


data sheet

Primers for sequencing vectors

Vectors Primers
pBluescriptR Insert 5′: T7 (Pr0202) GTAATACGACTCACTATAGGGC
Insert 3′: Reverse2 (Pr0100) GCGGATAACAATTTCACACAGG
pCMV-SPORT6 Insert 5′: Reverse2 (Pr0100) GCGGATAACAATTTCACACAGG
Insert 3′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Upstream of poly(A): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVNN
(V: mixture of A,G and C)
pCMV-SPORT6.1 Insert 5′: Reverse2 (Pr0100) GCGGATAACAATTTCACACAGG
Insert 3′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Upstream of poly(A): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVNN
(V: mixture of A,G and C)
pCMV-SPORT6.ccdb Insert 5′: Reverse2 (Pr0100) GCGGATAACAATTTCACACAGG
Insert 3′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Upstream of poly(A): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVNN
(V: mixture of A,G and C)
pCR4-TOPO Insert 5′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Insert 3′: Reverse2 (Pr0100) GCGGATAACAATTTCACACAGG
pDONR221 Insert 5′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Insert 3′:T7long (Pr0244) CGCCAAGCTCTAATACGACTCACTATAGGG
pDNR-Dual Insert 5′:T7long (Pr0244) CGCCAAGCTCTAATACGACTCACTATAGGG
Insert 3′:Dual-R (Pr0072) ATCCAAGCACTAGTCATGAC
pDNR-LIB Insert 5′:T7long (Pr0244) CGCCAAGCTCTAATACGACTCACTATAGGG
Insert 3′: M13 Reverse (Pr0042) AAACAGCTATGACCATGTTCA
pENTR/D-TOPO Insert 5′: M13_-40 (Pr0410) GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA
Insert 3′:T7long (Pr0244) CGCCAAGCTCTAATACGACTCACTATAGGG
pOTB7 (pBR322 ori) Insert 5′: pOTB7_F (Pr0224) AACGCGGCTACAATTAATACATAACC
Insert 3′: pOTB7_R (Pr0225) GTACTGCAGCCGATTCATTAATGC
Upstream of poly(A): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVNN
(V: mixture of A,G and C)

(GRP0032j 2010.12.02 T.M.)

2024.12.04



 

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