ヒト完全長cDNAクローンの概要
理研BRC・遺伝子材料開発室では、文部科学省「ゲノムネットワークプロジェクト」が収集・整備したヒト完全長cDNAクローンの提供を行っています。ゲノムネットワークプロジェクトクローンは、次の2種類です。
1)ヒト完全長cDNAコレクション
東京大学の菅野純夫博士ならびに理化学研究所の林崎良英博士のグループが収集・整備。ヒトの全遺伝子の6割に相当するおよそ14,000遺伝子、約3万クローン。
2)Gateway®エントリークローン
ヒト完全長cDNAコレクションから抜粋した6,300遺伝子分、約5万クローン。Gateway®エントリークローンのインサートDNAは、Gateway®テクノロジーにより種々のデスティネーションベクター(発現ベクター)へ簡単に移入することができます。なお、Gateway®エントリークローンには、独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発研究機構「完全長cDNA構造解析プロジェクト」において、バイオテクノロジー開発技術研究組合が作製したヒトcDNAクローンから作製したクローンも含んでいます。
- これらのヒト完全長cDNAクローンの開発と解析のプロジェクトの研究成果は、下記論文で発表され、クローンの詳細情報やタンパク質発現情報等がゲノムネットワークプロジェクトの公開データベース 「ゲノムネットワークプラットフォーム」から公開されています。
References:
- Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
- Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
- Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
- Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.
- ベクター情報はData Sheet
をご覧ください。
- 文献情報はInformaion site
をご覧ください。
- Gateway®テクノロジーについてはLife Technologies社の「Gateway クローニング」をご参照ください。
- 「完全長cDNA構造解析プロジェクト」にて取得されたヒトcDNAクローンについては、「独立行政法人製品評価技術基盤機構(NITE)」の「バイオテクノロジーセンター (NBRC)」ホームページをご覧下さい。
クローンのご依頼手順
1.クローン名の確認
キーワード検索の場合
A to Zリストの場合
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GNPデータベースの場合
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2.クローンの骨格ベクターの確認
完全長cDNAクローンの場合
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エントリークローンの場合
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- ベクター情報はData Sheet
をご覧下さい。
提供の概要
■ 当該クローンは学術機関による学術研究に限り提供可能です
提供手数料:(1本あたり)
非営利学術目的 8,440円
ベクターがpCMV SPORT6シリーズ(Gateway®発現ベクター)の場合、ライセンス料相当額 1,250円を追加でご負担いただきます。ライセンスについては「Gateway®テクノロジーを用いたクローンの提供と寄託のご案内 [link]」をご覧下さい。
ベクター情報はData Sheet をご覧下さい。
提供形態:
DNA(約1μg)
備考:
提供前にインサート末端配列の確認をします。
発送まで2週間のお時間を頂きます。ご了承下さい。
提供申込み
- 書式A (遺伝子材料提供依頼書)
書式A (遺伝子材料提供依頼書) [Word] 1部 - 遺伝子材料名欄1行目に「ゲノムネットワークプロジェクトクローン」と記入してください。
- 「カタログNo.」と「遺伝子材料名」は、次のように記載してください。
カタログNo. 遺伝子材料名
HGY088130 IRAL020F10
HGY084224 IRAL010J08
HGE091280 M01C028D08
HGE009243 W01A023B19
- 生物遺伝資源提供同意書、MTA
ゲノムネットワークプロジェクトクローン専用MTA (非営利学術目的用) [Word] 2部 - 下記利用条件がゲノムネットワークプロジェクトクローン専用書式C (非営利学術目的用)にあらかじめ記載されています。
- 利用者は、研究成果の公表にあたってバイオテクノロジー開発技術研究組合(以下「バイオ組合」という。)、理化学研究所 林崎 良英博士(林崎博士)並びに東京大学 菅野純夫教授(菅野教授)の指定する文献を引用する。
- Ota T. et al., Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat Genet. 36: 40-45, 2004.
- Otsuki T. et al., Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. DNA Res., 12: 117-126, 2005.
- Kimura K. et al., Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res., 16: 55-65, 2006.
- Itoh M., Yasunishi A., Imamura K., Kanamori M., Suzuki H., Suzuki M., Carninci P., Kawai J., Hayashizaki Y. Constructing ORFeome resources with removable termination codons, Biotechniques, 41: 44-48, 2006.
- 利用者は、研究成果の公表にあたってバイオ組合、林崎博士並びに菅野教授への謝辞の表明を必要とする。
- 本件リソースの使用は学術機関による学術研究に限る。
- バイオ組合は本件リソースの使用による潜在的な第三者の特許、著作権、商標もしくはその他の所有権等の権利侵害等についていかなる保証をするものではない。利用者は、本件リソースの使用、保存、処分等によって生じるいかなる損害及び第三者からの損害賠償等の請求について全ての責任を負うものとする。
- 利用者は、研究成果の公表にあたってバイオテクノロジー開発技術研究組合(以下「バイオ組合」という。)、理化学研究所 林崎 良英博士(林崎博士)並びに東京大学 菅野純夫教授(菅野教授)の指定する文献を引用する。
- Gateway®テクノロジーにより作製されたバイオリソースを使用される場合は、「Gateway®テクノロジーを用いたクローンの提供と寄託のご案内 [link]」の内容をお読み頂きLimited Use Label License: No.19 (GatewayR Cloning Products) [PDF]をダウンロードしてください。
- 書類の送付とお問い合わせ
- 書面をカラースキャンしたPDFファイルをemailにてお送りください。
紙面で公印またはサインが必要な場合は、後日、原本2部をご郵送ください。
なお、手続き完了した書類は、お送りいただいた方法でお届けいたします。 - 書類の送付先、問い合わせ先
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
理化学研究所バイオリソース研究センター
遺伝子材料開発室
E-mail: dnabank.brc@riken.jp
TEL: 029-836-3612 (平日の9:00~12:00 / 13:00~17:00)
FAX: 029-836-9120 - 提供申込の前に、「申込書類の記入と送付」「ご利用にあたって」「遺伝子材料の品質管理」をご覧ください。
- 書式の詳細は「申込みに必要な書式」をご覧ください。
- 書面をカラースキャンしたPDFファイルをemailにてお送りください。
お知らせとお問い合せ先
■ お知らせ
理研BRCは2009年7月2日にLife Technologies社(旧Invitrogen 社)とライセンス契約を締結しました。Life Technologies社の寛大な措置によって、「Gateway®エントリークローンならびにGateway®発現クローン」に組込まれたDNAリソースのご寄託と、当センターからの学術研究への提供が可能となりました。 続きはこちらへ
Gateway® はLife Technologies社の登録商標です。
■ お願い
理研BRCのリソースを用いて成果を論文発表される場合、寄託者の指定する論文の引用に加えて、リソースが理研BRCから提供されたことを次のように記載していただくようお願い申し上げます。
(Name of BIOLOGICAL RESOURCE) was provided by the RIKEN BRC through the National BioResource Project of the MEXT/AMED, Japan.
■問い合わせ先
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
理化学研究所バイオリソース研究センター
遺伝子材料開発室
E-mail: dnabank.brc@riken.jp
TEL: 029-836-3612 (平日の9:00~12:00 / 13:00~17:00)
FAX: 029-836-9120
Nucleotide Sequences of Vectors
For maps, lease visit the MGC and I.M.A.G.E.
Vector | Seq File & Primers | Link to PlasmID Repository (for nucleotide sequence) |
---|---|---|
pBluescriptR | Primer A: T7 GTAATACGACTCACTATAGGGC Primer B: Reverse2 GCGGATAACAATTTCACACAGG |
[link] |
pCMV-SPORT6 | Primer A: Reverse2 GCGGATAACAATTTCACACAGG Primer B: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer C: TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNN |
[link] |
pCMV-SPORT6.1 | Primer A: Reverse2 GCGGATAACAATTTCACACAGG Primer B: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer C: TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNN |
[link] |
pCMV-SPORT6.ccdb | Primer A: Reverse2 GCGGATAACAATTTCACACAGG Primer B: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer C: TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNN |
[link] |
pCR4-TOPO | Primer A: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer B: Reverse2 GCGGATAACAATTTCACACAGG |
[link] |
pDONR221 | Primer A: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer B: T7 TAATACGACTCACTATAGGG |
[link] |
pDNR-Dual | [link] | |
pDNR-LIB | Primer A: T7 TAATACGACTCACTATAGGG Primer B: M13 Reverse AAACAGCTATGACCATGTTCA |
[link] |
pENTR/D-TOPO | Primer A: M13 GTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA Primer B: T7 TAATACGACTCACTATAGGG |
[link] |
pOTB7 (pBR322 ori) |
Primer A: pOTB7_F(7-32) AACGCGGCTACAATTAATACATAACC Primer B: pOTB7_R(358-335) GTACTGCAGCCGATTCATTAATGC Primer C: TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNN |
[link] |
(GRP0032j 2010.12.02 T.M.)
2021.03.02