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理研ジーンバンク ニュースレターNo.9 (電子メール版)
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1998年・春のニュースレターをお届けします。最新情報は、インターネットホーム
ページをご参照下さい。
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お問い合わせ先
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理化学研究所ジーンバンク室 〒305-0074 つくば市高野台3-1-1
including
細胞開発銀行 TEL: 0298-36-3611、FAX: 0298-36-9130、cellbank@rtc.riken.go.jp
DNA開発銀行 TEL: 0298-36-3612、FAX: 0298-36-9120、dnabank@rtc.riken.go.jp
植物細胞開発銀行 TEL: 0298-36-9086、FAX: 0298-36-9085、pcbank@rtc.riken.go.jp
遺伝情報銀行 TEL: 0298-36-9082、FAX: 0298-36-9080、jouhou@rtc.riken.go.jp
Our WWW Home Page is http://www.rtc.riken.go.jp
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DNA開発銀行
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１ 電子メールアドレスの登録のお願い
理化学研究所ジーンバンクではユーザーの皆様に電子メールにて新規分譲可能動
物細胞株・遺伝子材料の最新情報を送るサービスを開始しております。つきまして
は、電子メールアドレスをご連絡いただきたく存じます。このサービスをご希望の
方は、各銀行のホームページの登録画面からお申し込みください。
また、DNA関連の技術交換や意見交換を行うメーリングリストに登録をご希望の
方は、その旨をdnabank@rtc.riken.go.jpまでご連絡ください。後日、当方からご
案内申し上げます。
２ 1998年度の理研ジーンバンク・総合カタログの発行は休みます
当バンクでは、科学技術会議の答申を受け、非営利・公共事業の一環として、かね
てから「細胞開発銀行」、「植物細胞開発銀行」、「ＤＮＡ開発銀行」、「遺伝情
報銀行」を運営してきております。現在、ユーザーはわが国のみならず、世界各国
に広がっております。1997年４月末に総合カタログNo.3を発行しました。
しかし、発行費用は相当の負担となり予算上の問題を発生するようになりましたの
で、1998年度の発行は休ませていただきます。最新情報はどうか、理研ジーンバ
ンクのホームページでご覧下さい。
なお総合カタログNo.3はまだ残部があります。本体は無料ですが、カタログは分
厚くなりますので、送料は各ユーザー負担としてお願い申し上げます。
国内の場合、郵便切手を最終ページの申込書に添えて、あらかじめお送り下さい。
また、料金受取人払いの書籍小包でもかまいません。そのむね、申込書に指定して
下さい。また、海外から申し込まれた場合は船便にてお送りします。この場合は、
まだ件数が少ない状況ですので無料で送付します。
３ 遺伝子材料および各種ライブラリー寄託のお願い
理化学研究所ジーンバンク室DNA開発銀行ではライフサイエンス研究推進事業の
一環として平成５年度より汎用宿主ベクター系とクローン化遺伝子を中心に収集と
分譲を行ってまいりました。今回も、クローン化遺伝子材料や各種ライブラリーの
寄託登録をお願いしております。寄託は以下のような流れで行われます。まず登録
していただく材料を当DNA開発銀行に送付していただき、DNA開発銀行ではそれを
増殖、検査、保存管理後、分譲可能となった遺伝子材料に関してカタログに掲載し
ます。カタログに掲載されている遺伝子材料は、研究者のリクエストに応じて官民
の別を問わず、どの研究者にも公平に分譲されます。
[寄託のメリット]
１. クレジット制度（遺伝子材料を寄託していただきますと寄託遺伝子数に見合
う株数まで無償で提供いたします。例えば３株寄託された場合、カタログ記載遺伝
子材料を３株取得できます。）
２. 分譲・使用制限を付けることが出来ます。
３. 品質管理・分譲を当バンクで行いますので、研究者自身による遺伝子株の分
譲の煩雑さが無くなります。また、貴重な遺伝子株の逸失を防ぐことができます。
４ CEPH Mega YAC clone libraryについて
昨年度４月よりCEPH MEGA YAC clone Libraryの分譲を再開いたしました。詳
細案内は総合カタログNo.3に掲載しましたので、分譲をご希望の方はカタログある
いは、ホームページをご参照ください。
５ DNA開発銀行・新規分譲可能遺伝子材料
新たに下記の遺伝子材料が寄託登録されました。遺伝子材料の寄託者の方々には、
室員一同、心より感謝致しております。有難うございました。これらにつきまして
は、４月より分譲可能となります。各遺伝子材料の詳細は、ホームページ上で公開
しています。
DNA Clone
RDB No. Name of clone Another Name Restriction
--------------------------------------------------------------------------
1810 TAG-1 cDNA b, x
1811 Human gene for elafin b, v
1812 Porcine gene for elafin Trappin-2 b, v
1813 Porcine gene for SPA1 Trappin-1, b, v
1814 Porcine gene for elafin homolog Trappin-3 b, v
1815 pRat A Rat wilson disease gene cDNA (Partial) b
1816 pMS316 fts I a, y
1817 pGen N54 RZ-1 (5' partial) a, z
1818 pgRZ-1 ES RZ-1 (3' partial) a, z
1819 pNS RZ-1 RZ-1 (cDNA) a, z
1822 lambda BmS 9 Sericin-1 genome gene a, y
1823 Bombyx cad Bm caudal a, y
1827 Bombyx hunchback Bm hb a, y
1828 Bombyx Antennapedia Bm Antp a, y
1829 Bombyx POU-M1/SGF-3 Silk gland factor-3 a, y
1830 Bombyx engrailed Bm en a, y
1831 Bombyx invected Bm in a, y
1836 Bombyx trachealess (N-terminal domain) Bm trh-N a, y
1837 Bombyx trachealess (C-terminal domain) Bm trh-C a, y
1838 p1.21 Mouse FGF-1 cDNA b, v
1839 p2.10 Mouse FGF-2 cDNA b, v
1840 p4.1 Mouse FGF-4 cDNA b, v
1841 p5.1 Mouse FGF-5 cDNA b, v
1842 p6.2 Mouse FGF-6 cDNA b, v
1843 p7.5 Mouse FGF-7 cDNA b, v
1844 p8.21 Mouse FGF-8 cDNA b, v
1845 p9.2 Mouse FGF-9 cDNA b, v
1846 pR1.40 Mouse FGF-R1 cDNA b, v
1847 pR2IIIb-1 Mouse FGF-R2 cDNA b, v
1848 pR3.3 Mouse FGF-R3 cDNA b, v
1849 pR4.31 Mouse FGF-R4 cDNA b, v
1850 pBK-CMV Vero-MCP Vero cell membrane cofactor protein c, y
1851 pC Tobacco cationic peroxidase isozyme 40 K a, z
1852 pD Tobacco cationic peroxidase isozyme 38 K a, z
1853 Human kf-1 cDNA H-kf-1 b, x
1854 Mouse kf-1 cDNA M-kf-1 b, x
1855 Bifidobacterium longum L-lactate dehydrogenase a, z
1856 REB REB bZIP protein b, y
1857 Human DHH genomic clone b, z
1858 P1 hBST-1 (partial sequence) a, y
1859 P3-1 hBST-1.2 (partial sequence) a, y
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注釈
ftsI : penicillin binding protein -3
Bm : Bombyx mori
POU : Pit-1/Oct/Unc-86
FGF : Fibroblast growth factor
FGFR : Fibroblast growth factor receptor
bZIP : Basic leucine -Zipper
BST : Bone marrow stromal cell antigen
RZ-1 : RNA-binding Zinc finger protein-1
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細胞開発銀行
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１ 培養に関する質問・相談用のメールアドレスが変わりました。
従来は細胞開発銀行に質問や相談をメールで送る場合、メールアドレスが
cellbank@rtc.riken.go.jpでしたが、培養に関する質問・相談用のメールアド
レスはcellqa@rtc.riken.go.jpとなりました。
尚、カタログ・分譲等の事務手続きについての質問は今まで通り
cellbank@rtc.riken.go.jpに送って下さい。
２ 細胞開発銀行・新規分譲可能動物細胞株
昨年秋10月のNewsletter No. 8以降、新規に分譲可能となったものは、下記のよ
うに20株となりました。これらには、E-mail News No. 7,8,9,10,11,12,13でお知
らせしたものが含まれております。1997年春発行の理研ジーンバンク総合カタログ
No. 3と合わせてご利用下さい。
なお、E-mail Newsは随時発行です。メールアドレスを細胞開発銀行に登録して
いただけば、無料で送信いたします。
Cell name CB No Restriction
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ψCRIP-MFGmIL-3 RCB1093 b
ψCRIP-MFGmIL-4 RCB1094 b
TUHR3TKB RCB1187 a
Anti-PT-S1-1B7 RCB1205 b
YNH-1 RCB1291 a
HNT-3 RCB1296 b
anti-αA-crystallin RCB1303 a
anti-αB-crystallin RCB1304 a
anti-β5-crystallin RCB1305 a
anti-β6-crystallin RCB1306 a
anti-γ1-crystallin RCB1307 a
anti-δ-crystallin RCB1308 a
C3H/HeN-emb RCB1311 a
C57BL/6J-emb RCB1312 a
CTB-1 RCB1316 b
KU-SN RCB1317 b
KU-YS RCB1318 b
HuH-6 RCB1367 b
HuH-7 RCB1366 b
MuSS RCB1378 b
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植物細胞開発銀行
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植物細胞開発銀行・新規分譲可能植物細胞株・植物遺伝子材料
新規分譲可能細胞株・遺伝子材料
遺伝子材料
CAT.No Clone Name Another Name Restriction
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RPD42 AtCDPK1 A.thaliana mRNA for calcium-dependent protein kinase b
RPD43 AtCDPK2 A.thaliana mRNA for calcium-dependent protein kinase b
RPD44 AtMPK4 A.thaliana thaliana mRNA for MAP kinase b
RPD45 AtMPK5 A.thaliana thaliana mRNA for MAP kinase b
RPD46 AtMPK6 A.thaliana thaliana mRNA for MAP kinase b
RPD47 AtMPK7 A.thaliana thaliana mRNA for MAP kinase b
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細胞株
植物名 細胞株名 培地 温度 状態
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ヘチマ Lcy-1 ＬＳ、NAA 27 懸濁培養
イネ OS-1 AA、2,4-D Kinetin 27 懸濁培養
ツルニチニチソウ Vma-1 27 懸濁培養
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培地組成、継代方法、分譲方法、その他詳細は、当銀行に直接FAXまたはe-mail
にてお問い合わせ下さい。
問い合わせ先：
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
理化学研究所ライフサイエンス筑波研究センター
ジーンバンク室 植物細胞開発銀行
TEL 0298-36-9086 FAX 0298-36-9085
e-mail : pcbank@rtc.riken.go.jp
（これは理研ジーンバンク総合カタログNo. 3発行後変更されております）
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遺伝情報銀行
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遺伝情報銀行のWWWによるオンラインサービスについて
遺伝情報銀行ではこれまで、利用者が当所の計算機に直接ログインして解析を行う
オンラインサービスを行ってきましたが、より多くの研究者に利用していただくた
め、WWWを用いたサービスに次第に移行しつつあります。現在、ジーンバンクのホー
ムページhttp://www.rtc.riken.go.jpから以下のようなサービスが利用できます。
（１）Simple Search：配列、構造データの簡単なエントリー検索やキーワード検索
ができます。
（２）ホモロジー検索：利用者の配列を種々のデータベースに対してホモロジー検
索することができます。
（３）GCG：GCGのWWWインターフェイス（利用には登録が必要です）、GCGの
オンラインマニュアル等が利用できます。
（４）3DinSight：生体分子の構造、物性と機能情報を関係データベース上に統合し
たデータベース、検索および可視化ツールです。構造データとしてはPDB (Protein
Data Bank) をミラリングしており最新の情報が得られます。エントリー、キーワー
ド、著者、分解能、２次構造上での配列のパターンなどの組合わせで検索を行えま
す。また、機能データとして、アミノ酸配列モチーフデータベース、PROSITE、の
情報を移殖し、これらを直接検索できるだけでなく、構造や物性情報とリンクでき
ます。また、構造に対応するアミノ酸配列の情報からその蛋白質の性質をグラフと
して見たり、対応する蛋白質の熱力学データを参照したりすることができます。さ
らに、蛋白質の突然変異に関する情報をリンクし、構造上で位置を確かめることが
できます。これらの検索された構造や機能部位の情報をただちに可視化するた
め、VRML (Virtual Reality Modeling Language)やRasMolなどの可視化ソフトを用い
て構造と機能部位をリアルタイムに表示できるようになっています。VRMLでは、
機能部位を対応するドキュメントにリンクし画面をクリックすることによりドキュ
メントを表示することもできます。その他、利用者の配列に対してPROSITEの機能
部位やPDBの配列ホモロジーの検索を行うこともできます。
（５）Gallery of Biomolecules：分子構造の画像データベース。ここでは、DNAの塩
基やアミノ酸といった基本的な部品から代表的な２次構造や３次構造のグラフィッ
クスを見ることができます。特に、蛋白質とDNAの複合体については、PDBに登録
されているすべての構造について画像データを作成し、ステレオ画像としてただちに
見られるようになっています。ほとんどのものはモチーフに分類されています。
これらの他に、これまでのオンラインサービスで提供しているGIAS (Genome
Information Analysis System)等のWeb化をすすめています。また、新しいデータベー
スや解析ツールを開発しており、順次公開してゆきたいと考えています。
ホームページのURLは http://www.rtc.riken.go.jp です。なお、このサービスは随時
変更がありますのでご了承下さい。これらのサービスに関しての質問等は以下宛て
にお願いします。
問い合わせ先：
〒305-0074 つくば市高野台3-1-1
理化学研究所ジーンバンク室
遺伝情報銀行 オンラインサービス係
TEL 0298-36-9082 FAX 0298-36-9080
E-mail: onlineop@rtc.riken.go.jp 又は jouhou@rtc.riken.go.jp
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公募
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平成11年度からの基礎科学特別研究員・候補者を探しています。
博士号所持者を対象としたポストドクのポジションで、純粋に研究のみを行い
ます。研究業績の評価が高ければ自己裁量で使用できる研究費が付きます。期間
は３年までで、採用決定は理研内部委員会で行われます。現在細胞開発銀行が、
「ヒトキラーＴ・ヘルパーＴ細胞の分化誘導とその応用研究」、または「ヒト癌
のキラーＴ細胞による治療研究」、または「ハイブリッド型人工リンパ節の開
発」DNA開発銀行が、「アンチセンス核酸医薬品開発のための基礎研究」、ま
たは「アンチセンスRNA 誘導転写因子、三重鎖結合 Zinc finger 蛋白質による発
癌遺伝子 c-myc の発現制御と分化誘導」、または「胚性幹細胞の分化誘導と E1A
結合性蛋白質 p300 による発癌遺伝子c-jun の発現制御」、または「アデノウイル
ス E1A と p300 による組織適合性抗原クラス I 遺伝子の発現抑制機構」、遺伝情
報銀行が、「計算機を用いた遺伝情報利用技術の研究」または「タンパク質・核
酸の構造・機能相関に関する物理化学的研究」のテーマで共同研究を行える方
を、それぞれ探しております。なお、あらかじめ研究テーマについての詳細を
聞きたい方は、下記にまで御連絡下さい。
資格：原則として博士号所持者。
待遇：月額50万円。研究費年額約135万円程度（海外学会旅費にも使用出来
ます。研究費不足分 は共同研究を行う各開発銀行が補填します）
勤務開始：平成11年４月（多少の調整も可能です）
〆切：早めにご連絡下さい。遅くとも平成１０年５月１日までに下記に連絡
して下さい。
問い合わせ先および書類送付先：
〒305-0074 つくば市高野台3-1-1 理化学研究所ジーンバンク室
細胞開発銀行：大野忠夫 (TEL 0298-36-9124 FAX 0298-36-9049)
DNA開発銀行：横山和尚 (TEL 0298-36-3612 FAX 0298-36-9120)
遺伝情報銀行：皿井明倫 (TEL 0298-36-9082 FAX 0298-36-9080)
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カタログ申込書
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Date:mm /dd /year (1998N)
理研ジーンバンク御中 To RIKEN GENE BANK
〒305-0074 つくば市高野台3-1-1 Koyadai, Tsukuba Science City, 305-0074
Ibaraki, Japan
総合カタログ申込書
(General Catalog Order Form)
（国内より） 理研ジーンバンクの総合カタログNo.3 1997年度版を以下にお送り
下さい。（どちらかに○印をつけて下さい）
（１） なお、送料として同封した郵便切手を利用して下さい。
部、必要ですので、切手の総額は 円分を同封しました。
（１部あたり520円です。）
（２）確実に送料受取人払いの書籍小包を受領することを約束できます。
（1部あたり￥540前後かかります。）
(From abroad) Please send me your new General Catalog by a surface mail
to the following.
（国内より） (From abroad)
部数： 部 Number of copies:
送付先： Send to:
氏名： Name (Type):
英名：
所属： Affiliation (Type):
住所：〒 Address (Type):
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署名（または印）：Signature by the responsible person :
(Type the name under here)
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