S. pombe ORFeome Cloneは理研吉田化学遺伝学研究室で作製され、吉田稔先生（理研吉田化学遺伝学研究室）より寄託していただいたもので、酵母 (Schizosaccharomyces pombe) ORFクローン約4800株のgenomic DNAクローンから構成されています。各々のクローンならびにセットでの提供が可能です。
| 1. Schizosaccharomyces pombe ORFeome clones |
| 1.1 Strain information |
| Species | Schizosaccharomyces pombe |
| Strain | wild-type strain JY3 |
| 1.2 Clone information |
| Entry clones |
| Vector | pDONR201 (Kanr), if not specified individually |
| Insert | PCR amplification of genomic DNA
Amplified with
5'-G GGG ACA AGT TTG TAC AAA AAA GCA GGC TCT CAT ATG-(template specific sequence)-3' and
5'-GGG GAC CAC TTT GTA CAA GAA AGC TGG GTA-(template specific sequence)-3'
as primers.
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| Host | DH5alpha, E. coli |
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| FLAG2-His6-tagged ORFs |
| Vector | pDUAL-FFH1c (Ampr), if not specified individually |
| Insert | Corresponding gene was cloned from the entry clone to pDUAL-FFH1c (RDB 6142) using the Gateway technology.
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| Host | DH5alpha, E. coli |
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| YFH-tagged ORFs |
| Vector | pDUAL-YFH1c (Ampr), if not specified individually |
| Insert | Corresponding gene was cloned from the entry clone to pDUAL-YFH1c (RDB 6151) using the Gateway technology.
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| Host | DH5alpha, E. coli |
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| 1.3 Reference |
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Matsuyama A., Arai R., Yashiroda Y., Shirai A., Kamata A., Sekido S., Kobayashi Y., Hashimoto A., Hamamoto M., Horaoka Y., Horinouchi S., Yoshida M. (2006) ORFeome cloning and global analysis of protein localization in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe.
Nature Biotech., 24, 841-847.
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A dataset including the cloning status of the ORFeome, protein expression levels, and localizome data is available by downloading the following CSV file:
ORFeome_Localizome_data.csv (2008.03.11, 1.18 mb)
(This file is also available at S. pombe postgenome database, http://www.riken.jp/SPD/index.html)
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A map of empty well in a 96-well plate of the entry clone set:
RDB6116.pdf (2009.08.28)
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| 共通項目 |
必要書式はこちらでダウンロードしてください。
遺伝子材料提供依頼書（書式A ） １部
生物遺伝資源提供同意書（書式6107C, MTA ） 2 部
書式6107Cの提供制限欄には次の4点を記入して下さい。
■ 利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者の指定する下記の文献を引用する。
指定文献：(Matsuyama et al., 2006, Nature Biotech., 24, 841-847)
■ 利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者への謝辞の表明を必要とする。
■ 利用者が本件リソース又はその派生物の販売を望む場合、書面により、寄託者の事前の承認を得る。
■ 寄託者から要請がある場合、理研ＢＲＣは利用者情報のうち研究責任者の氏名ならびにその所属機関名を寄託者に通知する。
（GFP, CFP, YFP を含むクローンとベクターの場合、追加で必要です）
「SCHEDULE A」 ２部
書式は、ここからダウンロードしてください。
（クローンセットの場合、追加で必要です）
「遺伝子組換え実験承認書」の写し、もしくは
遺伝子組換え生物の提供確認書（書式J ） １部
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| 単クローン |
S. pombe ORFeomeクローンはTEバッファに溶解したDNAでお送りします。
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 エントリークローン (SpENT)
書式A 遺伝子材料名欄
１行目には「RDB No. 5820 エントリークローン」を記入してください。
２行目から提供を希望される「クローンの番号 (例：03/A05)」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「S. pombe ORFeome clone」、固有記号欄は「No 5820」を記入してください。
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FLAG2-His6-tagged ORF (SpFFH)
書式A 遺伝子材料名欄
１行目には「RDB No. 6106 FLAG2-His6-tagged ORF」を記入してください。
２行目から提供を希望される「クローンの番号 (例：03/A05)」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「FLAG2-His6-tagged ORF」固有記号欄「No 6106」を記入してください。
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YFP-FLAG-His6-tagged ORF (SpYFH)
書式A 遺伝子材料名欄
１行目には「RDB No. 6107 YFH-tagged ORF」を記入してください。
２行目から提供を希望される「クローンの番号 (例：03/A05)」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「YFH-tagged ORF」固有記号欄「No 6107」を記入してください。
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| クローンセット |
S. pombe ORFeomeクローンセットはドライアイス梱包の大腸菌組換え体96穴プレートでお送りします。
「S. pombe ORFeome クローンセット」として提供を申込んで下さい。
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エントリークローンセット
書式A のRDB No. には「6116」を記入してください。遺伝子材料名欄には「エントリークローンセット」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「エントリークローンセット」固有記号欄「No 6116」を記入してください。
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FLAG2-His6-tagged ORF クローンセット
書式A のRDB No. には「6117」を記入してください。遺伝子材料名欄には「FLAG2-His6-tagged ORFセット」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「FLAG2-His6-tagged ORFセット」固有記号欄「No 6117」を記入してください。
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YFH-tagged ORF クローンセット
書式A のRDB No. には「6118」を記入してください。遺伝子材料名欄には「YFH-tagged ORFセット」を記入してください。
書式6107C のリソース名は「YFH-tagged ORFセット」固有記号欄「No 6118」を記入してください。
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| その他 |
■ S. pombe pDUAL, pDUAL2 ないし pREP series ベクターはTEバッファに溶解したDNAでお送りします。
■ S. pombe pDUAL, pDUAL2 ないし pREP series ベクターを提供依頼される場合は、専用の「生物遺伝資源提供同意書 (書式6107C, pdf) 」をご使用ください。
■ クローンのリストは、こちらをご覧下さい。
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| 宿主 | E. coli (DH5 alpha) |
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事業者名 | 独立行政法人理化学研究所 バイオリソースセンター
遺伝子材料開発室 |
| 核酸の名称 | Schizosaccharomyces pombe genomic DNA clone |
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所在地 | 〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1 |
| 挿入遺伝子の名称 | Schizosaccharomyces pombe coding sequence |
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担当責任者 | 遺伝子材料開発室 室長 |
| 封じ込めレベル | P1 |
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連絡先 | FAX：029-836-9120, E-mail：dnabank@brc.riken.jp |
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