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BAC Clone Set

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NBRP Rat (Rattus norvegicus) genome BAC clone

  Rat BAC (ja)   Rat BAC (en)   Data Sheet

概要

    京都大学にて開発され、理研GSCによるゲノム解析が行われたラット BACクローンが寄託されました。得られた各クローンのBACエンド配列をラットゲノム配列上にマッピングし、「F344 & LE Rat BAC ブラウザ」として公開しています。研究者は、このブラウザ上で目的とするゲノム領域のBACクローン(F344/StmもしくはLE/Stm由来)を選択し、利用することが可能です
    NBRP Rat  ナショナルバイオリソースプロジェクト ラット  NBRP2

    ナショナルバイオリソースプロジェクト「ラット」(NBRP-Rat)に関連する3編の論文について、 京都大学による関連記事

提供形態ならびに提供申込方法


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外部データベース


様式ダウンロード

申込書類送付
個別クローンを発注される方は、リンク先の外部データベースでクローンを検索し、様式ダウンロードページで入手した書式に必要事項を記入し、書式を作成してください。
F344 & LE Rat BAC ブラウザ
(別のウインドウで開く)
NBRP Rat BACクローンは組換え体スタブアガーでお送りします。
    クローンを受け取ったら、単コロニーの分離をしてください。培養は50 ug/ml Ampを添加した2x LBを使います。
    液体培養とDNAの調製はページ上のタブ「BAC DNA Preparation」をご覧下さい。
必要書式は
    遺伝子材料提供依頼書(書式A ) 1部
    生物遺伝資源提供同意書(書式C, MTA ) 2 部
    「遺伝子組換え実験承認書」の写し [もしくは遺伝子組換え生物の提供確認書(書式J)] 1部
RNB1
F344/Stm
書式A の遺伝子材料名欄には1行目に「NBRP Rat BAC clone RNB1」を記入し、
2行目から提供を希望される「クローンの番号 (例:RNB1-456A01)」を記入してください。
カタログNo. (RDB)欄の記入は不要です。

書式C のリソース名は「NBRP Rat BAC clone RNB1(別紙書式A参照)」を記入し、固有記号欄は「RDB 6273」を記入してください。 書式C の提供制限欄には次の1点を記入して下さい。

■ 利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者の指定する文献を引用する (The STAR Consortium, SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat. Nat. Genet. 40, 560-566, 2008)。
RNB2
LE/Stm
書式A の遺伝子材料名欄には1行目に「NBRP Rat BAC clone RNB2」を記入し、
2行目から提供を希望される「クローンの番号 (例:RNB2-456A01)」を記入してください。
カタログNo. (RDB)欄の記入は不要です。

書式C のリソース名は「NBRP Rat BAC clone RNB2(別紙書式A参照)」を記入し、固有記号欄は「RDB 6274」を記入してください。 書式C の提供制限欄には次の1点を記入して下さい。

■ 利用者は、研究成果の公表にあたって寄託者の指定する文献を引用する (The STAR Consortium, SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat. Nat. Genet. 40, 560-566, 2008)。

《書類の送付先、問合先》
    〒305-0074
    茨城県つくば市高野台3-1-1
    理化学研究所 バイオリソースセンター 
    遺伝子材料開発室
    FAX:029-836-9120
    e-mail: dnabank@brc.riken.jp

遺伝子材料提供の概要はこのページをご覧下さい。

使用上の注意

第二種使用等を目的とした遺伝子組換え生物です。
宿主E. coli (DH10B)   事業者名独立行政法人理化学研究所 バイオリソースセンター
遺伝子材料開発室
核酸の名称ラット BAC クローン   所在地〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
挿入遺伝子の名称ラットゲノムDNA   担当責任者室長
封じ込めレベルP1   連絡先 FAX:029-836-9120, E-mail:dnabank@brc.riken.jp

関連情報

国立がん研究センター研究所の中釜斉博士ならびに落合雅子博士が樹立したラットF344/Jcl 系統ならびにACI/NJcl 系統のBACクローン化ライブラリーも収集しています。F344/Jcl 系統はすでに当開発室から提供を開始しているBACクローン化ライブラリーの F344/Stm 系統とは異なる亜系統です。もう一つのACI/NJcl 系統は、遺伝子解析が進んでいるBN系統やF344系統と遺伝的に離れており、発がん感受性、偏腎症の発症、独自の主要組織適合遺伝子複合体(RT1)タイプを持つこと等が挙げられ、疾患モデルとして非常に有用な系統です。

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(T.M. 2009.06.13)


2013.04.13